La contrainteligencia en la Policía Federal es llevada a cabo por la Unidad de Asuntos Internos. Cuenta con tres direcciones generales: Vigilancia y Supervisión Interna; Investigación Interna, y Responsabilidades. Además, cinco oficinas que se abrieron en este año para agilizar supuestamente las investigaciones y no esperar hasta que en el centro de la República se conozca de los asuntos sensibles de la dependencia.
Un documento de esta, en el papel, poderosa Unidad, encabezada por la comisaria general María Luisa Saucedo López, da cuenta de las debilidades o “amenazas institucionales” que padece la Policía Federal mexicana: corrupción de sus agentes; irracionalidad en sus conductas; indiferencia y negligencia en su servicio, y ausencia de resultados efectivos.
