Alfonso Mendoza se ha desempeñado en distintos cargos en instituciones como la Agencia Federal de Investigación (AFI), la Secretaría de Seguridad Pública (SSP), la Secretaría de Gobernación (Segob), la Policía Federal (PF) y la Fiscalía General de la República (FGR).
Alfonso Mendoza Ramírez fue designado al frente del despacho de la Jefatura General de la Policía de Investigación (PDI), en sustitución de Francisco Almazán Barocio, quien presentó su renuncia al cargo que desempeñó desde octubre de 2019, informó la Fiscalía General de Justicia de la Ciudad de México (FGJ-CdMx).