Durante el sexenio del expresidente Felipe Calderón, el coronel Cosgaya era el militar de confianza del mandatario federal y trabajó como jefe de la Subdirección de Operaciones contra el Narcotráfico así como en la coordinación de todas las operaciones entre 2009 y 2012 contra líderes criminales.
Emilio Cosgaya Rodríguez, militar vinculado a proceso por delincuencia organizada relacionada con el robo de hidrocarburos, afirmó que la Secretaría de la Defensa Nacional (Sedena) busca quitarle a su familia la vivienda que la institución le asignó antes de ser detenido.
A través de una publicación en Facebook, el perfil de Emilio Cosgaya Rodríguez actualmente administrado por su familia, denunció que la Sedena busca sacar a su familia de su vivienda pese a que él no ha sido declarado culpable de los delitos que la Fiscalía General de la República (FGR) le imputó.